主流经济学主要是指新古典经济学。方法论特征主要表现为关于人的行为的理性假设和“均衡”分析的处理方法，可以有效地分析消费者、生产者、组织集团等行为主体的市场行为、非市场行为及其相互关系（岂不是什么都能分析！）

经济学有两种类型：Milton Fridamn的“轮椅里的经济学”方法论和Ronald Coase的“直面现象的经济学”方法论。

新制度经济学遵循经济学的自由主义传统，用新古典经济学的方法研究制度，在传统经济学的三大基石（禀赋、技术、偏好）的基础上引入第四大基石----制度，作为内生经济变量，与法学、政治学、社会学、人类学、历史学、组织科学、管理学和道德哲学都有重要的联系。制度限制了人能采取的机会主义行为，保护人们个人的自由领域，帮助人们避免或缓和冲突，增加劳动和知识的分工，并因此促进繁荣。

新制度经济学的三大理论支柱：制度变迁理论、产权理论、交易费用理论，如果将集体行为理论与意识形态理论考虑进去，则分四大部分。

新古典经济学由AlfredMarshall（英，1890，经济学原理）创建，以均衡分析方法，运用边际分析方法研究供求，核心是均衡价格，解决稀缺资源在多用途中的最优配置问题。论证“看不见的手”原理的存在，高度赞扬价格制度，认为资本主义制度可以自我调节，解决各种矛盾。

新古典经济学的理论体系包括微观经济学（C Menger, L Warlras, J W Robison, Edward HChamberlain, J Von Neumann, John Nash, R Selten, Gary SBecker）和宏观经济学（R Keynes, Paul A Samuelson），并不断的完善。

新古典经济学有严格的基本假设。

假设1 稀缺性和人类的欲望无止境。不想物理学家或化学家，经济学家眼里只有稀缺的东西才值得研究。

假设2 “经济人”。思维正常的人追求经济利益最大化。但无法解释“雷锋现象”。

假设3完全理性和完全信息。人清楚经济运行的所有情况。如果存在完全信息，市场就会消失，计划配给；如果存在完全信息，企业就会消失，由市场说了算。（哪个对？）

假设4 完全竞争。

假设5 零交易费用。

假设6 市场和企业制度给定，即经济组织给定。抛开制度，未将制度作为“生产要素”，其实制度多变。

假设7 技术外生。

假设8 社会成员的个人偏好能通过某种方式表现为社会福利函数。意味着如果满足了偏好，就等于创造了社会福利。

这些假设面临挑战。

对完全理性的质疑。直接批评来自西蒙的“有限理性”，由于信息不完全，问题复杂和未来的不确定性，人的能力有限，只能追求满意决策，而非最优；间接批判来自KenethJ Arrow和博弈论，个人理性选择可能产生非理性结果，与社会理性选择不一致。

对个体主义的不满。新古典经济学是个体主义的研究方法，具有个体主义的效率观，效率是资源配置到“最高”即金钱最合算的用途上，社会效率是个人效率的总和。但人不总是、不都是追求自私自利的。

利用价格的成本：交易费用。微观经济学是关于价格和交换的理论。交换的实质不是物品或服务，而是各自的权利，价格机制运行必须依靠明晰可转让的产权，使用价格机制是需支付成本的。

打开企业（经济组织）黑箱。新古典经济学将企业作为生产实体，探讨企业如何决策，根据边际替代原则对生产要素进行最优化组合，实现产量最大或成本最低。企业被简化为“使利润最大化”的黑箱。但大量的交易在企业内部完成，需要打开黑箱。（学校也是“企业”。）

制度外生。新古典主义研究资源配置，假定技术、制度是外生变量，制度安排和市场交易无成本。Douglass CNorth（1993）“一旦交易变得昂贵时，制度便至关重要了。并且，交易又的确是昂贵的（那么制度肯定是重要的了）。”资源配置的实际决定因素是那个社会有组织的结构，即其制度，把经济作为一种体制的组织和控制。

模型的机械、静态性质。供求曲线只描述了“量”，无法反映“质”。市场能解决“生产多少”，但不能解决“生产什么样的多少”。

一旦抽出这些，新古典经济学就不成立了，所以新制度经济学是对新古典经济学的补充，但更高端，更全面，更接近现实。